pipeline/codes/public/cnvkit/access-5k-mappable.hg19.bed

480 lines
11 KiB
Plaintext
Raw Permalink Normal View History

2023-10-18 15:59:11 +08:00
chrM 0 1
chr1 10000 177417
chr1 227417 267719
chr1 317719 471368
chr1 521368 564449
chr1 570371 2583334
chr1 2684220 3845268
chr1 3995268 5725866
chr1 5736651 13052998
chr1 13102998 13219912
chr1 13319912 13557162
chr1 13607162 17125658
chr1 17175658 29878082
chr1 30028082 103863906
chr1 103913906 120697156
chr1 120747156 120936695
chr1 121086695 121485434
chr1 142535434 142731022
chr1 142781022 142967761
chr1 143117761 143292816
chr1 143342816 143544525
chr1 143644525 143771002
chr1 143871002 144095783
chr1 144145783 144224481
chr1 144274481 144401744
chr1 144451744 144622413
chr1 144672413 144710724
chr1 144810724 145833118
chr1 145883118 146164650
chr1 146214650 146253299
chr1 146303299 148026038
chr1 148176038 148361358
chr1 148511358 148684147
chr1 148734147 148954460
chr1 149004460 149459645
chr1 149509645 205922707
chr1 206072707 206332221
chr1 206482221 223747846
chr1 223797846 235192211
chr1 235242211 238104075
chr1 238109627 248908210
chr1 249058210 249240621
chr2 10000 3529312
chr2 3579312 5018788
chr2 5118788 16279724
chr2 16329724 21153113
chr2 21178113 87668206
chr2 87718206 89630436
chr2 89830436 89848588
chr2 89879994 90321525
chr2 90371525 90545103
chr2 91595103 92267522
chr2 95326171 110109337
chr2 110251337 132966374
chr2 132977849 132980437
chr2 132988895 132994855
chr2 133007983 149690582
chr2 149790582 234003741
chr2 234053741 239801978
chr2 239831978 240784132
chr2 240809132 243102476
chr2 243152476 243189373
chr3 60000 66170270
chr3 66270270 90311686
chr3 93519133 125374455
chr3 125388784 194041961
chr3 194047251 197825427
chr3 197834080 197962430
chr4 12822 1423146
chr4 1478646 8799203
chr4 8818203 9274642
chr4 9324642 31820917
chr4 31837417 32834638
chr4 32840638 49338941
chr4 49488941 49633314
chr4 49660115 49660117
chr4 52660117 59739333
chr4 59789333 64205457
chr4 64210679 75427379
chr4 75452279 156377740
chr4 156387314 190190746
chr4 190203442 191026302
chr5 10000 17517177
chr5 17600940 21477365
chr5 21497415 34177882
chr5 34197574 45908253
chr5 49554574 91636128
chr5 91686128 99381556
chr5 99390873 134258949
chr5 134264271 138787073
chr5 138837073 155138727
chr5 155188727 180905260
chr6 60000 58087659
chr6 58137659 58745955
chr6 61944008 62128589
chr6 62178589 62189892
chr6 62206612 62207809
chr6 62230644 95680543
chr6 95830543 157559467
chr6 157609467 157641300
chr6 157691300 167942073
chr6 168042073 170279972
chr6 170329972 171055067
chr7 10000 232484
chr7 282484 50370631
chr7 50410631 56728753
chr7 56737434 57544726
chr7 57556913 57811488
chr7 57836990 57939184
chr7 61360513 61364202
chr7 61375111 61377582
chr7 61417405 61420850
chr7 61430697 61434041
chr7 61459495 61460020
chr7 61510465 61510467
chr7 61525376 61534875
chr7 61560797 61561322
chr7 61586778 61590126
chr7 61600145 61603605
chr7 61643429 61645900
chr7 61656808 61677020
chr7 61727020 61779527
chr7 61803114 61845691
chr7 61898240 61902994
chr7 61967157 61967159
chr7 62010012 62014418
chr7 62030067 62031164
chr7 62047971 62049315
chr7 62054339 62068904
chr7 62077078 62080589
chr7 62099669 62103307
chr7 62127240 62133407
chr7 62156047 62157745
chr7 62181400 62182390
chr7 62188977 62189619
chr7 62196444 62203300
chr7 62260528 62261334
chr7 62319285 62325304
chr7 62360768 62375367
chr7 62402052 62402771
chr7 62409492 62412943
chr7 62431079 62437880
chr7 62446647 62447717
chr7 62452850 63484955
chr7 63492257 63686197
chr7 63693336 63699195
chr7 63704200 63742029
chr7 63761971 63828588
chr7 63841231 63852570
chr7 63862101 64059157
chr7 64066183 64066715
chr7 64078443 64090864
chr7 64105357 64113305
chr7 64120263 74715724
chr7 74765724 100556043
chr7 100606043 130154523
chr7 130254523 139379377
chr7 139404377 142048195
chr7 142098195 142276197
chr7 142326197 143347897
chr7 143397897 154270634
chr7 154370634 159128663
chr8 10000 7474649
chr8 7524649 12091854
chr8 12141854 43399486
chr8 47457541 47545982
chr8 47559215 47725534
chr8 47742797 47750844
chr8 47776101 47792900
chr8 47804990 48130499
chr8 48135599 86576451
chr8 86726451 142766515
chr8 142816515 145332588
chr8 145432588 146304022
chr9 10000 39663686
chr9 39713686 39974796
chr9 40024796 40233029
chr9 40283029 40425834
chr9 40475834 40940341
chr9 40990341 41143214
chr9 41193214 41365793
chr9 41415793 42613955
chr9 42663955 43213698
chr9 43313698 43946569
chr9 43996569 44676646
chr9 44726646 44908293
chr9 44958293 45250203
chr9 45350203 45815521
chr9 45865521 46216430
chr9 46266430 46461039
chr9 46561039 47060133
chr9 47160133 47317679
chr9 65467679 65918360
chr9 65968360 66192215
chr9 66242215 66404656
chr9 66454656 66614195
chr9 66664195 66863343
chr9 66913343 67107834
chr9 67207834 67366296
chr9 67516296 67987998
chr9 68137998 68514181
chr9 68664181 68838946
chr9 68988946 69278385
chr9 69328385 70010542
chr9 70060542 70218729
chr9 70318729 70506535
chr9 70556535 70735468
chr9 70835468 92343416
chr9 92443416 92528796
chr9 92678796 133073060
chr9 133223060 137041193
chr9 137091193 139166997
chr9 139216997 141153431
chr10 60000 17974675
chr10 18024675 18841533
chr10 18862467 38772277
chr10 38868835 38868886
chr10 38889025 39076515
chr10 42602110 42661264
chr10 42667623 42790522
chr10 42818398 46426964
chr10 46476964 47429169
chr10 47529169 47792476
chr10 47892476 48055707
chr10 48105707 49095536
chr10 49195536 51137410
chr10 51187410 51398845
chr10 51448845 125869472
chr10 125919472 128616069
chr10 128766069 133381404
chr10 133431404 133677527
chr10 133727527 135524747
chr11 60000 1162759
chr11 1212759 48671444
chr11 48902406 48931242
chr11 48964015 50072292
chr11 50077862 50318471
chr11 51374066 51567242
chr11 55027975 69089801
chr11 69139801 69724695
chr11 69774695 87688378
chr11 87738378 96287584
chr11 96437584 134946516
chr12 60000 95739
chr12 145739 7189876
chr12 7239876 34432028
chr12 37856694 37915829
chr12 37925832 37989447
chr12 38441828 109373470
chr12 109423470 122530623
chr12 122580623 132706992
chr12 132806992 133841895
chr13 19020000 86760324
chr13 86910324 112353994
chr13 112503994 114325993
chr13 114425993 114639948
chr13 114739948 115109878
chr14 19056900 107289540
chr15 20044132 20894633
chr15 20935075 21398819
chr15 21885000 22212114
chr15 22262114 22596193
chr15 22646193 23514853
chr15 23564853 29159443
chr15 29209443 82829645
chr15 82879645 84984473
chr15 85034473 102521392
chr16 60000 8636921
chr16 8686921 32493036
chr16 32570826 32574990
chr16 32588304 32590063
chr16 32598801 33864355
chr16 34173150 34180539
chr16 34197081 34530115
chr16 34542632 34596974
chr16 34606456 34789896
chr16 34806999 34883460
chr16 34898122 34907613
chr16 34917676 34935231
chr16 34945101 34989886
chr16 35014295 35014971
chr16 35020566 35149246
chr16 35157585 35158151
chr16 35169154 35169760
chr16 35178074 35193580
chr16 46456668 88389383
chr16 88439383 90294753
chr17 0 296626
chr17 396626 21566608
chr17 21666608 21766609
chr17 21791933 22018520
chr17 22032049 22157851
chr17 22167531 22171818
chr17 22190964 22221073
chr17 25263006 25263010
chr17 25268059 25489687
chr17 25508249 25516108
chr17 25524439 34675848
chr17 34725848 62410760
chr17 62460760 77546461
chr17 77596461 79709049
chr17 79759049 81195210
chr18 10000 105658
chr18 112233 15381634
chr18 15390839 15398545
chr18 18510898 18510901
chr18 18520342 52059136
chr18 52209136 72283353
chr18 72333353 75721820
chr18 75771820 78017248
chr19 60000 7346004
chr19 7396004 8687198
chr19 8737198 20523415
chr19 20573415 21670503
chr19 21681650 22021715
chr19 22030630 22056990
chr19 22063052 22088431
chr19 22094452 22098015
chr19 22107067 22109694
chr19 22119771 22208494
chr19 22219477 22222529
chr19 22233207 22421387
chr19 22429701 22435249
chr19 22443618 22508167
chr19 22535119 22896519
chr19 22916751 22993858
chr19 23009540 23097041
chr19 23103096 23113931
chr19 23119694 23197493
chr19 23208940 23227244
chr19 23240447 23241092
chr19 23252259 23277826
chr19 23286027 23438232
chr19 23445010 23488972
chr19 23505312 23640698
chr19 23647740 23703016
chr19 23708250 23723471
chr19 23730305 23956385
chr19 23963761 23964461
chr19 23972510 24079258
chr19 24085253 24156856
chr19 24171961 24232248
chr19 24245481 24246057
chr19 24251805 24252747
chr19 24258122 24364512
chr19 24376216 24385266
chr19 28262682 36756398
chr19 36800948 37759473
chr19 37797722 59118983
chr20 60000 25946119
chr20 25956134 26257032
chr20 29419569 29498600
chr20 29506823 29653908
chr20 29803908 34897085
chr20 34947085 61091437
chr20 61141437 61213369
chr20 61263369 62965520
chr21 9411193 9595548
chr21 9645548 9694896
chr21 9704962 9775437
chr21 9825437 9827612
chr21 9845233 10034920
chr21 10084920 10215976
chr21 10365976 10647896
chr21 10697896 10708995
chr21 10736605 10742706
chr21 10766786 10772809
chr21 10829531 10830174
chr21 10860718 11186054
chr21 14369791 42955559
chr21 43005559 44632664
chr21 44682664 48119895
chr22 16050000 16697850
chr22 16862659 18876789
chr22 18884510 20509431
chr22 20609431 50364777
chr22 50414777 51244566
chrX 60000 94821
chrX 144821 231384
chrX 281384 1047557
chrX 1097557 1134113
chrX 1184113 1264234
chrX 1314234 2068238
chrX 2118238 7623882
chrX 7673882 10738674
chrX 10788674 37098256
chrX 37148256 49242997
chrX 49292997 49974173
chrX 50024173 52395914
chrX 52445914 58180601
chrX 58185903 58187995
chrX 58212105 58319184
chrX 58330843 58354020
chrX 58373962 58488898
chrX 58494528 58506076
chrX 58536883 58544061
chrX 61927096 61936569
chrX 61959547 61967845
chrX 61973104 61979195
chrX 61998594 62003205
chrX 62041580 76653692
chrX 76703692 113517668
chrX 113567668 115682290
chrX 115732290 120013235
chrX 120063235 143507324
chrX 143557324 148906424
chrX 148956424 149032062
chrX 149082062 152277099
chrX 152327099 155260560
chrY 10000 44821
chrY 94821 181384
chrY 231384 997557
chrY 1047557 1084113
chrY 1134113 1214234
chrY 1264234 2018238
chrY 2068238 7735811
chrY 7752887 7785067
chrY 7806311 7806856
chrY 7814704 7815230
chrY 7820478 7832744
chrY 7848695 7875409
chrY 7885257 7886545
chrY 7894591 7898927
chrY 7916812 7926344
chrY 7936705 7941130
chrY 7947438 7948790
chrY 7964448 8181757
chrY 8213330 8220421
chrY 8230061 8240772
chrY 8265916 8296944
chrY 8321375 8326678
chrY 8333466 8334027
chrY 8342387 8356544
chrY 8369346 8914955
chrY 8964955 9241322
chrY 9291322 10040627
chrY 10045657 10059394
chrY 10073694 10080736
chrY 10104539 10104553
chrY 13104553 13143954
chrY 13193954 13252193
chrY 13259484 13445957
chrY 13490591 13642186
chrY 13870984 19764063
chrY 19776198 19783669
chrY 19796396 19808085
chrY 19817100 20143885
chrY 20193885 20362679
chrY 20371694 20383383
chrY 20396110 20403581
chrY 20415713 22369679
chrY 22419679 23159001
chrY 23167737 23236898
chrY 23248080 23901428
chrY 23951428 24953159
chrY 24975657 24980997
chrY 24991235 25022753
chrY 25039185 25048332
chrY 25059258 25099139
chrY 25121882 25122419
chrY 25160800 25182404
chrY 25192372 26586905
chrY 26609405 26614745
chrY 26624983 26656502
chrY 26672934 26682081
chrY 26693007 26732883
chrY 26755623 26756160
chrY 26794538 26816148
chrY 26826116 27136281
chrY 27146249 27167859
chrY 27206241 27206778
chrY 27229502 27269388
chrY 27280315 27289462
chrY 27305895 27337415
chrY 27347656 27352996
chrY 27375497 28784129
chrY 58819361 58819367
chrY 58917648 58917656
chrY 58967656 59363566